home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ ftp.cs.arizona.edu / ftp.cs.arizona.edu.tar / ftp.cs.arizona.edu / icon / newsgrp / group93a.txt / 000090_icon-group-sender _Thu Mar 18 12:24:03 1993.msg < prev    next >
Internet Message Format  |  1993-04-21  |  3KB
  1. Received: by cheltenham.cs.arizona.edu; Thu, 18 Mar 1993 14:17:52 MST
  2. Date: Thu, 18 Mar 1993 12:24:03 -0500
  3. Message-Id: <9303181724.AA25412@medinah.atc.ucarb.com>
  4. To: icon-group@cs.arizona.edu
  5. From: far@medinah.atc.ucarb.com
  6. Subject: ICON application to chemical process modelling?
  7. Status: R
  8. Errors-To: icon-group-errors@cs.arizona.edu
  9.  
  10. I'd like to have a 'topological' copmuter model of a specific group of
  11. chemical reactions which give a very complex product mixture.
  12.  
  13. The reaction is nucleophilic displacement by ammonia (and by the resulting
  14. intermediate amines) on the C-Cl bonds of 1,2-dichloroethane (EDC).  The
  15. products are commonly known to chemists as ethyleneamines (i.e.- they are
  16. formed of the -NCH2CH2- repeat unit)
  17.  
  18. I want to supply to the model:
  19.  
  20. * an integer value for the number of molecules of ammonia and/or already
  21. formed ethyleneamines
  22.  
  23. * an integer value for the number of molecules of EDC
  24.  
  25. * rules for what new bonds can be formed [this will determine the possible
  26. structures of the final products]
  27.  
  28. * adjustable relative rate parameters (or liklihoods of) each type of
  29. displacement reaction.  There are only about 6 [ammonia, primary NH2,
  30. secondary NH, secondary cyclic NH, intramolecular primay NH2 and
  31. intramolecular secondary NH].
  32.  
  33. What I want from the model is a product distribution.  (#s of each
  34. different kind of molecular structure)
  35.  
  36. The kicker here is that I want to rely on the program to generate the
  37. structures.
  38.  
  39. Existing approaches to computational reaction modelling mostly involve
  40. energetics to decide relative liklihood of following different reaction
  41. pathways.  The computational resources required for such models are large
  42. because of this energetic approach.
  43.  
  44. I wish to shortcut that by using RELATIVE rates.
  45.  
  46. Also, existing approaches require the model-user to supply the reaction
  47. pathways and product structures.  I hope this 'exhausting enumeration' can
  48. be avoided by a program that keeps track of which new bonds are formed, to
  49. determine the product structure and (ideally) represent it graphically
  50. (e.g.-
  51.  
  52.       CH2-CH2
  53.      /      \
  54.    HN        NH
  55.      \      /
  56.       CH2-CH2     )  [structure drawn in monospaced font]
  57.  
  58. for piperazine, a common product of the reaction of ammonia with EDC
  59.  
  60. I am not much of a programmer but have decided to learn ICON because of my
  61. recreational interest in Text analysis/synthesis, machine translation,
  62. poetry generation, etc. and use of generated text in creative endeavours
  63. both artistic and problem solving.  (JOOTSing)
  64.  
  65. I wonder if it is reasonable to try to use ICON for programming the model I
  66. sketch above?
  67.  
  68. Suggestions and criticism are welcome.
  69.  
  70.  
  71. Forrest Richey
  72.  
  73.